El Reglamento del PPGEpi describe directrices exhaustivas que rigen las operaciones de los programas de Maestría y Doctorado. Estos incluyen capítulos que detallan objetivos, administración, facultad, asesores, procedimientos de admisión, inscripción, estructura curricular, metodologías de enseñanza, disertaciones, tesis, grados académicos y representación estudiantil. Además, el Reglamento abarca disposiciones generales y transitorias. Actualizado en 2020, el Reglamento está disponible públicamente para consulta.