El programa de Maestría en la UFPel busca desarrollar investigadores innovadores que contribuyan al avance y comprensión de la Epidemiología. Así mismo, la Maestría busca desarrollar epidemiólogos con experiencia en trabajo de campo, con habilidad para organizar y recolectar información primaria, así como con habilidad para analizar la información recogida. El programa recibió una calificación CAPES de 7, que es la calificación máxima y representa excelencia a partir de los estándares internacionales.

El programa está construido a partir de cursos teóricos y prácticos lo que le permite a los estudiantes trabajar en sus propuestas de investigación y en revisión de la literatura. Los estudiantes deben asistir a las clases obligatorias para completar el número de créditos requerido para presentar su disertación de investigación final. La disertación final consiste en una propuesta de investigación, un reporte de resultados de trabajo de campo y un artículo para ser publicado en una revista científica. La mayor parte de los estudiantes concluye sus actividades investigativas antes de los dos últimos meses del programa.

La maestría en Epidemiología de la UFPel fue el primer programa en Brasil en adoptar un método de investigación conocido como Consorcio, en el que los estudiantes realizan investigaciones de forma colectiva. Este sistema permite la investigación a través del análisis de datos y da a los estudiantes un amplio conocimiento sobre bioestadística que incluye modelos básicos y sofisticados de regresión como el modelo logístico, la regresión de Poisson y modelos multinivel. Los estudiantes eligen su tema de análisis, preparan una propuesta de investigación y recogen datos en un estudio poblacional- transversal. Todos los estudiantes tienen acceso a los datos de las investigaciones, con lo que si un estudiante lo requiere, puede solicitarlos para complementar su proyecto. El método Consortium reduce el tiempo y el costo de la recolección de datos, sin limitar el alcance y la relevancia de los estudios. El 80% de los estudiantes ha publicado al menos un artículo basado en su investigación y aproximadamente el 90% de esos artículos fue publicado en revistas internacionales con clasificación CAPES de A.